Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MS4A1P11836 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MS4A1P11836 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms