Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RALAP11233 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RALAP11233 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RALAP11233 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RALAP11233 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RALAP11233 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RALAP11233 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RALAP11233 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RALAP11233 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RALAP11233 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RALAP11233 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RALAP11233 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RALAP11233 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RALAP11233 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RALAP11233 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RALAP11233 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RALAP11233 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RALAP11233 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RALAP11233 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RALAP11233 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RALAP11233 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RALAP11233 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RALAP11233 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RALAP11233 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RALAP11233 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RALAP11233 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RALAP11233 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RALAP11233 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RALAP11233 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RALAP11233 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RALAP11233 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RALAP11233 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RALAP11233 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RALAP11233 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RALAP11233 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RALAP11233 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RALAP11233 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RALAP11233 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RALAP11233 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RALAP11233 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RALAP11233 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RALAP11233 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RALAP11233 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RALAP11233 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RALAP11233 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RALAP11233 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RALAP11233 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RALAP11233 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RALAP11233 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RALAP11233 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RALAP11233 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RALAP11233 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RALAP11233 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RALAP11233 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RALAP11233 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RALAP11233 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RALAP11233 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RALAP11233 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RALAP11233 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RALAP11233 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RALAP11233 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RALAP11233 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RALAP11233 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RALAP11233 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RALAP11233 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RALAP11233 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RALAP11233 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RALAP11233 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RALAP11233 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RALAP11233 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RALAP11233 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RALAP11233 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RALAP11233 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RALAP11233 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RALAP11233 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RALAP11233 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RALAP11233 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RALAP11233 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RALAP11233 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RALAP11233 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RALAP11233 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RALAP11233 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RALAP11233 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RALAP11233 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RALAP11233 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RALAP11233 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RALAP11233 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RALAP11233 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RALAP11233 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RALAP11233 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RALAP11233 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RALAP11233 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RALAP11233 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RALAP11233 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RALAP11233 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RALAP11233 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RALAP11233 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RALAP11233 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RALAP11233 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RALAP11233 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms