Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD28P10747 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD28P10747 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD28P10747 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CD28P10747 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD28P10747 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD28P10747 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD28P10747 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD28P10747 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD28P10747 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD28P10747 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD28P10747 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD28P10747 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD28P10747 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD28P10747 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD28P10747 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD28P10747 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD28P10747 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD28P10747 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD28P10747 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD28P10747 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD28P10747 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD28P10747 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD28P10747 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD28P10747 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD28P10747 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD28P10747 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD28P10747 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD28P10747 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD28P10747 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD28P10747 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD28P10747 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD28P10747 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD28P10747 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD28P10747 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD28P10747 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD28P10747 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CD28P10747 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD28P10747 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD28P10747 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD28P10747 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CD28P10747 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD28P10747 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD28P10747 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD28P10747 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD28P10747 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD28P10747 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD28P10747 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CD28P10747 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD28P10747 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD28P10747 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD28P10747 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD28P10747 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD28P10747 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD28P10747 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CD28P10747 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CD28P10747 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD28P10747 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CD28P10747 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD28P10747 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD28P10747 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD28P10747 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD28P10747 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CD28P10747 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD28P10747 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD28P10747 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD28P10747 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD28P10747 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD28P10747 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD28P10747 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD28P10747 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD28P10747 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD28P10747 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD28P10747 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CD28P10747 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD28P10747 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD28P10747 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD28P10747 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD28P10747 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD28P10747 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD28P10747 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD28P10747 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD28P10747 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD28P10747 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD28P10747 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD28P10747 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CD28P10747 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD28P10747 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD28P10747 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CD28P10747 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD28P10747 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD28P10747 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD28P10747 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD28P10747 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD28P10747 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD28P10747 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD28P10747 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD28P10747 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD28P10747 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD28P10747 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms