Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP3P10745 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP3P10745 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP3P10745 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP3P10745 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP3P10745 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP3P10745 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBP3P10745 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBP3P10745 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBP3P10745 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP3P10745 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP3P10745 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP3P10745 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP3P10745 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP3P10745 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP3P10745 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP3P10745 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP3P10745 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP3P10745 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP3P10745 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP3P10745 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP3P10745 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP3P10745 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP3P10745 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP3P10745 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP3P10745 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP3P10745 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP3P10745 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP3P10745 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP3P10745 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP3P10745 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP3P10745 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP3P10745 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP3P10745 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP3P10745 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP3P10745 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP3P10745 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP3P10745 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP3P10745 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP3P10745 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP3P10745 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP3P10745 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP3P10745 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP3P10745 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP3P10745 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP3P10745 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP3P10745 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP3P10745 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP3P10745 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP3P10745 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP3P10745 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP3P10745 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP3P10745 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP3P10745 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP3P10745 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP3P10745 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP3P10745 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBP3P10745 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBP3P10745 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBP3P10745 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBP3P10745 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBP3P10745 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBP3P10745 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBP3P10745 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBP3P10745 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RBP3P10745 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBP3P10745 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP3P10745 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP3P10745 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP3P10745 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP3P10745 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP3P10745 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP3P10745 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP3P10745 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP3P10745 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP3P10745 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP3P10745 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP3P10745 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP3P10745 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP3P10745 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP3P10745 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP3P10745 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBP3P10745 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBP3P10745 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBP3P10745 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBP3P10745 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBP3P10745 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBP3P10745 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBP3P10745 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBP3P10745 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBP3P10745 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RBP3P10745 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBP3P10745 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBP3P10745 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP3P10745 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP3P10745 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP3P10745 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP3P10745 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP3P10745 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP3P10745 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms