Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf88P0DMB2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms