Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SRGAP2CP0DJJ0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms