Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA6AP0CW24 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms