Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L7P0C7H9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L7P0C7H9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms