Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
POLA1P09884 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
POLA1P09884 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
POLA1P09884 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
POLA1P09884 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
POLA1P09884 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
POLA1P09884 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
POLA1P09884 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
POLA1P09884 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
POLA1P09884 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
POLA1P09884 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
POLA1P09884 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
POLA1P09884 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
POLA1P09884 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
POLA1P09884 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
POLA1P09884 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
POLA1P09884 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
POLA1P09884 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
POLA1P09884 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC37.71■■■■□ 3.63
POLA1P09884 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC37.71■■■■□ 3.63
POLA1P09884 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
POLA1P09884 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
POLA1P09884 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
POLA1P09884 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
POLA1P09884 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
POLA1P09884 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
POLA1P09884 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
POLA1P09884 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
POLA1P09884 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
POLA1P09884 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
POLA1P09884 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
POLA1P09884 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
POLA1P09884 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
POLA1P09884 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
POLA1P09884 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
POLA1P09884 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
POLA1P09884 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
POLA1P09884 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
POLA1P09884 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC37.67■■■■□ 3.62
POLA1P09884 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
POLA1P09884 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
POLA1P09884 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
POLA1P09884 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
POLA1P09884 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
POLA1P09884 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
POLA1P09884 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
POLA1P09884 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
POLA1P09884 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
POLA1P09884 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
POLA1P09884 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
POLA1P09884 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
POLA1P09884 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
POLA1P09884 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
POLA1P09884 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
POLA1P09884 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
POLA1P09884 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
POLA1P09884 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
POLA1P09884 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
POLA1P09884 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
POLA1P09884 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
POLA1P09884 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
POLA1P09884 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
POLA1P09884 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
POLA1P09884 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
POLA1P09884 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
POLA1P09884 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
POLA1P09884 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
POLA1P09884 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
POLA1P09884 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
POLA1P09884 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
POLA1P09884 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
POLA1P09884 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
POLA1P09884 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
POLA1P09884 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
POLA1P09884 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
POLA1P09884 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
POLA1P09884 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC37.62■■■■□ 3.61
POLA1P09884 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
POLA1P09884 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
POLA1P09884 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
POLA1P09884 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
POLA1P09884 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
POLA1P09884 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
POLA1P09884 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
POLA1P09884 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
POLA1P09884 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
POLA1P09884 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
POLA1P09884 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
POLA1P09884 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
POLA1P09884 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
POLA1P09884 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
POLA1P09884 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
POLA1P09884 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
POLA1P09884 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
POLA1P09884 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
POLA1P09884 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
POLA1P09884 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
POLA1P09884 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
POLA1P09884 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
POLA1P09884 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms