Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MMP10P09238 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MMP10P09238 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MMP10P09238 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MMP10P09238 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MMP10P09238 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MMP10P09238 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MMP10P09238 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MMP10P09238 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MMP10P09238 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MMP10P09238 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MMP10P09238 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MMP10P09238 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP10P09238 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP10P09238 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP10P09238 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP10P09238 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP10P09238 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP10P09238 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP10P09238 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP10P09238 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP10P09238 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP10P09238 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP10P09238 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP10P09238 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP10P09238 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP10P09238 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP10P09238 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP10P09238 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP10P09238 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP10P09238 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP10P09238 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MMP10P09238 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MMP10P09238 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MMP10P09238 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MMP10P09238 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MMP10P09238 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MMP10P09238 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MMP10P09238 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MMP10P09238 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MMP10P09238 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MMP10P09238 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MMP10P09238 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MMP10P09238 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MMP10P09238 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MMP10P09238 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MMP10P09238 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MMP10P09238 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MMP10P09238 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MMP10P09238 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MMP10P09238 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MMP10P09238 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MMP10P09238 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MMP10P09238 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MMP10P09238 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MMP10P09238 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MMP10P09238 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MMP10P09238 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP10P09238 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP10P09238 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP10P09238 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP10P09238 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP10P09238 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP10P09238 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP10P09238 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP10P09238 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP10P09238 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMP10P09238 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMP10P09238 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMP10P09238 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMP10P09238 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMP10P09238 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMP10P09238 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMP10P09238 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMP10P09238 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMP10P09238 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMP10P09238 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMP10P09238 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMP10P09238 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MMP10P09238 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MMP10P09238 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MMP10P09238 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MMP10P09238 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MMP10P09238 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MMP10P09238 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MMP10P09238 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MMP10P09238 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MMP10P09238 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
MMP10P09238 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MMP10P09238 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MMP10P09238 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MMP10P09238 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MMP10P09238 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMP10P09238 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMP10P09238 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMP10P09238 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMP10P09238 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMP10P09238 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMP10P09238 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMP10P09238 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.7 ms