Protein–RNA interactions for Protein: P08727

KRT19, Keratin, type I cytoskeletal 19, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT19P08727 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT19P08727 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT19P08727 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KRT19P08727 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT19P08727 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT19P08727 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT19P08727 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT19P08727 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT19P08727 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT19P08727 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT19P08727 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT19P08727 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT19P08727 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT19P08727 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT19P08727 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT19P08727 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT19P08727 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT19P08727 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT19P08727 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT19P08727 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT19P08727 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT19P08727 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT19P08727 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT19P08727 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT19P08727 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT19P08727 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT19P08727 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT19P08727 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT19P08727 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT19P08727 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT19P08727 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT19P08727 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT19P08727 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT19P08727 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT19P08727 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT19P08727 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT19P08727 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT19P08727 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT19P08727 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT19P08727 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT19P08727 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT19P08727 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT19P08727 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT19P08727 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT19P08727 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT19P08727 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT19P08727 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT19P08727 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT19P08727 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT19P08727 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT19P08727 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT19P08727 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT19P08727 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT19P08727 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT19P08727 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT19P08727 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT19P08727 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT19P08727 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT19P08727 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT19P08727 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT19P08727 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT19P08727 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT19P08727 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT19P08727 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT19P08727 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT19P08727 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT19P08727 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT19P08727 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT19P08727 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT19P08727 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT19P08727 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT19P08727 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT19P08727 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT19P08727 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT19P08727 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT19P08727 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT19P08727 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT19P08727 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT19P08727 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT19P08727 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT19P08727 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT19P08727 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT19P08727 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT19P08727 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT19P08727 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT19P08727 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT19P08727 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT19P08727 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT19P08727 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT19P08727 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT19P08727 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT19P08727 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT19P08727 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT19P08727 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT19P08727 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT19P08727 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT19P08727 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT19P08727 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT19P08727 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT19P08727 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms