Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRCP08575 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms