Protein–RNA interactions for Protein: P07949

RET, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETP07949 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETP07949 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETP07949 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETP07949 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETP07949 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETP07949 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RETP07949 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETP07949 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETP07949 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RETP07949 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETP07949 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RETP07949 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RETP07949 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RETP07949 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RETP07949 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RETP07949 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RETP07949 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RETP07949 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RETP07949 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RETP07949 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RETP07949 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RETP07949 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RETP07949 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RETP07949 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RETP07949 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RETP07949 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RETP07949 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RETP07949 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RETP07949 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RETP07949 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RETP07949 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RETP07949 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RETP07949 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RETP07949 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RETP07949 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RETP07949 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RETP07949 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RETP07949 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RETP07949 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RETP07949 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RETP07949 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RETP07949 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RETP07949 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RETP07949 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RETP07949 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RETP07949 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RETP07949 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RETP07949 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RETP07949 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RETP07949 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RETP07949 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RETP07949 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RETP07949 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RETP07949 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RETP07949 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RETP07949 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RETP07949 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RETP07949 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RETP07949 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RETP07949 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RETP07949 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RETP07949 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RETP07949 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RETP07949 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RETP07949 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RETP07949 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RETP07949 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RETP07949 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RETP07949 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RETP07949 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RETP07949 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RETP07949 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RETP07949 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RETP07949 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RETP07949 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RETP07949 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RETP07949 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RETP07949 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RETP07949 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RETP07949 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RETP07949 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RETP07949 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RETP07949 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RETP07949 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RETP07949 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RETP07949 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RETP07949 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RETP07949 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RETP07949 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RETP07949 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RETP07949 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RETP07949 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RETP07949 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RETP07949 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RETP07949 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RETP07949 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RETP07949 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RETP07949 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RETP07949 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RETP07949 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms