Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NEFMP07197 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEFMP07197 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NEFMP07197 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEFMP07197 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEFMP07197 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEFMP07197 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEFMP07197 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEFMP07197 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEFMP07197 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEFMP07197 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
NEFMP07197 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEFMP07197 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEFMP07197 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEFMP07197 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEFMP07197 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEFMP07197 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEFMP07197 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEFMP07197 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEFMP07197 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEFMP07197 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NEFMP07197 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEFMP07197 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEFMP07197 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEFMP07197 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NEFMP07197 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEFMP07197 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NEFMP07197 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEFMP07197 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEFMP07197 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEFMP07197 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEFMP07197 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEFMP07197 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NEFMP07197 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEFMP07197 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEFMP07197 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEFMP07197 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEFMP07197 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEFMP07197 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEFMP07197 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEFMP07197 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEFMP07197 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEFMP07197 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEFMP07197 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEFMP07197 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEFMP07197 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NEFMP07197 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NEFMP07197 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NEFMP07197 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEFMP07197 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEFMP07197 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEFMP07197 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEFMP07197 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEFMP07197 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NEFMP07197 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEFMP07197 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEFMP07197 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEFMP07197 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEFMP07197 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEFMP07197 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NEFMP07197 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEFMP07197 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEFMP07197 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEFMP07197 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEFMP07197 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEFMP07197 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NEFMP07197 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEFMP07197 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEFMP07197 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEFMP07197 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
NEFMP07197 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEFMP07197 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEFMP07197 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEFMP07197 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEFMP07197 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEFMP07197 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NEFMP07197 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEFMP07197 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEFMP07197 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEFMP07197 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEFMP07197 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEFMP07197 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEFMP07197 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEFMP07197 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEFMP07197 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEFMP07197 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEFMP07197 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEFMP07197 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEFMP07197 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEFMP07197 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEFMP07197 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEFMP07197 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEFMP07197 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEFMP07197 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEFMP07197 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEFMP07197 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEFMP07197 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEFMP07197 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NEFMP07197 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEFMP07197 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms