Protein–RNA interactions for Protein: P05976

MYL1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL1P05976 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYL1P05976 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYL1P05976 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYL1P05976 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYL1P05976 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYL1P05976 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYL1P05976 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYL1P05976 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYL1P05976 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYL1P05976 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MYL1P05976 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYL1P05976 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYL1P05976 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYL1P05976 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYL1P05976 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYL1P05976 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYL1P05976 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYL1P05976 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYL1P05976 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYL1P05976 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MYL1P05976 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYL1P05976 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYL1P05976 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MYL1P05976 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYL1P05976 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYL1P05976 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYL1P05976 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYL1P05976 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYL1P05976 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYL1P05976 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYL1P05976 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYL1P05976 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYL1P05976 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYL1P05976 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYL1P05976 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYL1P05976 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYL1P05976 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYL1P05976 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYL1P05976 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYL1P05976 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYL1P05976 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYL1P05976 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYL1P05976 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYL1P05976 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MYL1P05976 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYL1P05976 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYL1P05976 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYL1P05976 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYL1P05976 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYL1P05976 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MYL1P05976 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MYL1P05976 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MYL1P05976 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYL1P05976 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYL1P05976 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYL1P05976 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYL1P05976 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYL1P05976 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYL1P05976 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYL1P05976 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYL1P05976 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYL1P05976 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MYL1P05976 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYL1P05976 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYL1P05976 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYL1P05976 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYL1P05976 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYL1P05976 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MYL1P05976 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYL1P05976 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYL1P05976 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYL1P05976 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYL1P05976 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYL1P05976 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYL1P05976 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYL1P05976 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYL1P05976 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYL1P05976 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MYL1P05976 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYL1P05976 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYL1P05976 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYL1P05976 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYL1P05976 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYL1P05976 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYL1P05976 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYL1P05976 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYL1P05976 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYL1P05976 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYL1P05976 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYL1P05976 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYL1P05976 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYL1P05976 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYL1P05976 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYL1P05976 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYL1P05976 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYL1P05976 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYL1P05976 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYL1P05976 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYL1P05976 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYL1P05976 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms