Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYBBP04839 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYBBP04839 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYBBP04839 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYBBP04839 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYBBP04839 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYBBP04839 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYBBP04839 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYBBP04839 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYBBP04839 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYBBP04839 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYBBP04839 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYBBP04839 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYBBP04839 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYBBP04839 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYBBP04839 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYBBP04839 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYBBP04839 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYBBP04839 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYBBP04839 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CYBBP04839 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYBBP04839 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYBBP04839 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYBBP04839 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYBBP04839 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYBBP04839 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYBBP04839 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYBBP04839 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYBBP04839 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYBBP04839 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYBBP04839 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYBBP04839 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYBBP04839 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYBBP04839 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYBBP04839 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYBBP04839 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYBBP04839 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYBBP04839 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYBBP04839 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYBBP04839 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYBBP04839 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYBBP04839 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYBBP04839 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYBBP04839 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYBBP04839 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYBBP04839 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYBBP04839 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYBBP04839 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CYBBP04839 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYBBP04839 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYBBP04839 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYBBP04839 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYBBP04839 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYBBP04839 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYBBP04839 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYBBP04839 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYBBP04839 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CYBBP04839 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYBBP04839 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYBBP04839 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYBBP04839 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYBBP04839 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYBBP04839 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYBBP04839 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYBBP04839 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYBBP04839 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYBBP04839 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYBBP04839 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYBBP04839 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYBBP04839 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYBBP04839 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYBBP04839 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYBBP04839 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYBBP04839 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYBBP04839 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CYBBP04839 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYBBP04839 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYBBP04839 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CYBBP04839 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYBBP04839 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYBBP04839 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYBBP04839 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYBBP04839 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYBBP04839 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYBBP04839 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYBBP04839 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYBBP04839 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYBBP04839 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYBBP04839 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYBBP04839 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYBBP04839 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYBBP04839 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYBBP04839 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYBBP04839 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYBBP04839 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYBBP04839 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYBBP04839 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYBBP04839 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYBBP04839 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYBBP04839 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms