Protein–RNA interactions for Protein: P04278

SHBG, Sex hormone-binding globulin, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBGP04278 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHBGP04278 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHBGP04278 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHBGP04278 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHBGP04278 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHBGP04278 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHBGP04278 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHBGP04278 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHBGP04278 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHBGP04278 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHBGP04278 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHBGP04278 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHBGP04278 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHBGP04278 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHBGP04278 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHBGP04278 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHBGP04278 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHBGP04278 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHBGP04278 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHBGP04278 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHBGP04278 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHBGP04278 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHBGP04278 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHBGP04278 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHBGP04278 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHBGP04278 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHBGP04278 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHBGP04278 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHBGP04278 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHBGP04278 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHBGP04278 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHBGP04278 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHBGP04278 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHBGP04278 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHBGP04278 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHBGP04278 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SHBGP04278 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHBGP04278 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHBGP04278 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHBGP04278 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHBGP04278 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHBGP04278 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHBGP04278 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHBGP04278 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHBGP04278 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHBGP04278 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHBGP04278 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHBGP04278 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHBGP04278 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SHBGP04278 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHBGP04278 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHBGP04278 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHBGP04278 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHBGP04278 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHBGP04278 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHBGP04278 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHBGP04278 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHBGP04278 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHBGP04278 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHBGP04278 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHBGP04278 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHBGP04278 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHBGP04278 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHBGP04278 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SHBGP04278 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHBGP04278 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHBGP04278 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHBGP04278 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHBGP04278 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHBGP04278 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHBGP04278 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHBGP04278 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHBGP04278 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHBGP04278 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHBGP04278 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHBGP04278 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHBGP04278 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHBGP04278 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHBGP04278 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHBGP04278 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHBGP04278 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHBGP04278 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHBGP04278 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHBGP04278 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHBGP04278 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHBGP04278 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SHBGP04278 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHBGP04278 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHBGP04278 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHBGP04278 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHBGP04278 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHBGP04278 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHBGP04278 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHBGP04278 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SHBGP04278 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHBGP04278 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHBGP04278 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHBGP04278 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHBGP04278 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHBGP04278 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms