Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC3P02656 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC3P02656 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC3P02656 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC3P02656 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC3P02656 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC3P02656 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC3P02656 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC3P02656 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC3P02656 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC3P02656 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC3P02656 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC3P02656 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC3P02656 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC3P02656 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC3P02656 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC3P02656 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC3P02656 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC3P02656 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC3P02656 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC3P02656 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC3P02656 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC3P02656 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
APOC3P02656 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
APOC3P02656 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC3P02656 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC3P02656 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC3P02656 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC3P02656 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC3P02656 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC3P02656 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC3P02656 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC3P02656 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC3P02656 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC3P02656 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC3P02656 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC3P02656 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC3P02656 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC3P02656 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC3P02656 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC3P02656 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC3P02656 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC3P02656 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC3P02656 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC3P02656 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC3P02656 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC3P02656 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC3P02656 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC3P02656 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC3P02656 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC3P02656 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC3P02656 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC3P02656 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC3P02656 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC3P02656 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC3P02656 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC3P02656 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC3P02656 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC3P02656 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC3P02656 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC3P02656 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC3P02656 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC3P02656 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC3P02656 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC3P02656 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC3P02656 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC3P02656 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC3P02656 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC3P02656 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC3P02656 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC3P02656 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC3P02656 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC3P02656 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC3P02656 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC3P02656 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC3P02656 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC3P02656 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC3P02656 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC3P02656 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC3P02656 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC3P02656 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOC3P02656 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC3P02656 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC3P02656 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC3P02656 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC3P02656 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC3P02656 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC3P02656 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC3P02656 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC3P02656 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC3P02656 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOC3P02656 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC3P02656 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC3P02656 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC3P02656 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC3P02656 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC3P02656 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC3P02656 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC3P02656 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOC3P02656 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms