Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EGFRP00533 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EGFRP00533 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EGFRP00533 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EGFRP00533 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EGFRP00533 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EGFRP00533 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EGFRP00533 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EGFRP00533 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
EGFRP00533 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
EGFRP00533 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EGFRP00533 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
EGFRP00533 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EGFRP00533 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EGFRP00533 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EGFRP00533 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EGFRP00533 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
EGFRP00533 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
EGFRP00533 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EGFRP00533 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EGFRP00533 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EGFRP00533 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EGFRP00533 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EGFRP00533 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EGFRP00533 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
EGFRP00533 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
EGFRP00533 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EGFRP00533 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EGFRP00533 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EGFRP00533 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EGFRP00533 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EGFRP00533 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EGFRP00533 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EGFRP00533 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
EGFRP00533 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EGFRP00533 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EGFRP00533 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EGFRP00533 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
EGFRP00533 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EGFRP00533 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EGFRP00533 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EGFRP00533 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EGFRP00533 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EGFRP00533 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EGFRP00533 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EGFRP00533 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EGFRP00533 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EGFRP00533 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EGFRP00533 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EGFRP00533 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EGFRP00533 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EGFRP00533 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EGFRP00533 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EGFRP00533 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EGFRP00533 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EGFRP00533 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EGFRP00533 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EGFRP00533 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EGFRP00533 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EGFRP00533 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EGFRP00533 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EGFRP00533 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EGFRP00533 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EGFRP00533 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EGFRP00533 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EGFRP00533 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EGFRP00533 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EGFRP00533 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EGFRP00533 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
EGFRP00533 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
EGFRP00533 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EGFRP00533 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EGFRP00533 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EGFRP00533 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EGFRP00533 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EGFRP00533 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EGFRP00533 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EGFRP00533 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EGFRP00533 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EGFRP00533 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EGFRP00533 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EGFRP00533 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EGFRP00533 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EGFRP00533 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EGFRP00533 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EGFRP00533 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EGFRP00533 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EGFRP00533 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EGFRP00533 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EGFRP00533 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
EGFRP00533 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EGFRP00533 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EGFRP00533 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EGFRP00533 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EGFRP00533 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EGFRP00533 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EGFRP00533 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EGFRP00533 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EGFRP00533 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EGFRP00533 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms