Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TOP3BO95985 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms