Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAPINO95295 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms