Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms