Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLSTN1O94985 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN1O94985 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms