Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOBTB3O94955 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOBTB3O94955 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6367 ms