Protein–RNA interactions for Protein: O94886

TMEM63A, CSC1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM63AO94886 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM63AO94886 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM63AO94886 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms