Protein–RNA interactions for Protein: O94782

USP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1O94782 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP1O94782 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP1O94782 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP1O94782 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP1O94782 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP1O94782 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP1O94782 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP1O94782 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP1O94782 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP1O94782 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP1O94782 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP1O94782 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP1O94782 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP1O94782 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP1O94782 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP1O94782 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP1O94782 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP1O94782 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP1O94782 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP1O94782 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP1O94782 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP1O94782 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP1O94782 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP1O94782 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP1O94782 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP1O94782 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP1O94782 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP1O94782 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP1O94782 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP1O94782 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP1O94782 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP1O94782 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP1O94782 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP1O94782 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP1O94782 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP1O94782 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP1O94782 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP1O94782 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP1O94782 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP1O94782 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP1O94782 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP1O94782 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP1O94782 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP1O94782 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP1O94782 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP1O94782 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP1O94782 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP1O94782 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP1O94782 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP1O94782 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP1O94782 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP1O94782 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP1O94782 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP1O94782 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP1O94782 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP1O94782 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP1O94782 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP1O94782 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP1O94782 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP1O94782 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP1O94782 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP1O94782 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP1O94782 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
USP1O94782 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP1O94782 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP1O94782 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP1O94782 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP1O94782 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP1O94782 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP1O94782 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP1O94782 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP1O94782 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP1O94782 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP1O94782 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP1O94782 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP1O94782 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP1O94782 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP1O94782 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP1O94782 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP1O94782 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP1O94782 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP1O94782 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP1O94782 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP1O94782 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP1O94782 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP1O94782 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP1O94782 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP1O94782 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP1O94782 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP1O94782 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP1O94782 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP1O94782 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP1O94782 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP1O94782 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP1O94782 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP1O94782 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP1O94782 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP1O94782 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP1O94782 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP1O94782 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms