Protein–RNA interactions for Protein: O76015

KRT38, Keratin, type I cuticular Ha8, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT38O76015 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT38O76015 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT38O76015 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT38O76015 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT38O76015 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT38O76015 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT38O76015 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT38O76015 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT38O76015 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT38O76015 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT38O76015 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT38O76015 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT38O76015 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT38O76015 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT38O76015 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT38O76015 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT38O76015 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT38O76015 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT38O76015 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT38O76015 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT38O76015 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT38O76015 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT38O76015 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT38O76015 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT38O76015 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT38O76015 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT38O76015 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT38O76015 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT38O76015 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT38O76015 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT38O76015 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT38O76015 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT38O76015 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT38O76015 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT38O76015 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT38O76015 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT38O76015 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT38O76015 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT38O76015 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT38O76015 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT38O76015 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT38O76015 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT38O76015 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT38O76015 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT38O76015 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT38O76015 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT38O76015 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT38O76015 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT38O76015 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT38O76015 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT38O76015 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT38O76015 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT38O76015 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT38O76015 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT38O76015 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT38O76015 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT38O76015 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT38O76015 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT38O76015 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT38O76015 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT38O76015 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT38O76015 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT38O76015 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT38O76015 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT38O76015 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT38O76015 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT38O76015 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT38O76015 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT38O76015 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT38O76015 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT38O76015 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT38O76015 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT38O76015 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT38O76015 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KRT38O76015 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KRT38O76015 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT38O76015 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT38O76015 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT38O76015 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT38O76015 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT38O76015 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT38O76015 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT38O76015 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT38O76015 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT38O76015 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT38O76015 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT38O76015 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT38O76015 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT38O76015 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT38O76015 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT38O76015 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT38O76015 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT38O76015 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT38O76015 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT38O76015 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT38O76015 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT38O76015 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT38O76015 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT38O76015 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT38O76015 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms