Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SURF6O75683 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SURF6O75683 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SURF6O75683 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SURF6O75683 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
SURF6O75683 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SURF6O75683 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SURF6O75683 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SURF6O75683 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SURF6O75683 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SURF6O75683 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SURF6O75683 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SURF6O75683 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SURF6O75683 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SURF6O75683 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SURF6O75683 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SURF6O75683 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SURF6O75683 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SURF6O75683 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SURF6O75683 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SURF6O75683 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SURF6O75683 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SURF6O75683 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SURF6O75683 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SURF6O75683 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SURF6O75683 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SURF6O75683 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SURF6O75683 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SURF6O75683 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SURF6O75683 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SURF6O75683 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SURF6O75683 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SURF6O75683 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SURF6O75683 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SURF6O75683 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SURF6O75683 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SURF6O75683 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SURF6O75683 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SURF6O75683 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SURF6O75683 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SURF6O75683 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SURF6O75683 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SURF6O75683 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SURF6O75683 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SURF6O75683 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SURF6O75683 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SURF6O75683 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SURF6O75683 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SURF6O75683 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SURF6O75683 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SURF6O75683 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SURF6O75683 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SURF6O75683 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SURF6O75683 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SURF6O75683 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SURF6O75683 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SURF6O75683 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SURF6O75683 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SURF6O75683 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SURF6O75683 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SURF6O75683 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SURF6O75683 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SURF6O75683 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SURF6O75683 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.51■■■□□ 2
SURF6O75683 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SURF6O75683 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SURF6O75683 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SURF6O75683 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SURF6O75683 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SURF6O75683 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SURF6O75683 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SURF6O75683 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SURF6O75683 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SURF6O75683 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SURF6O75683 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SURF6O75683 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SURF6O75683 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SURF6O75683 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SURF6O75683 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SURF6O75683 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SURF6O75683 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SURF6O75683 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SURF6O75683 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SURF6O75683 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SURF6O75683 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SURF6O75683 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SURF6O75683 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SURF6O75683 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SURF6O75683 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SURF6O75683 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SURF6O75683 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SURF6O75683 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SURF6O75683 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SURF6O75683 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SURF6O75683 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SURF6O75683 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SURF6O75683 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SURF6O75683 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SURF6O75683 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SURF6O75683 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms