Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms