Protein–RNA interactions for Protein: O60542

PSPN, Persephin, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPNO60542 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSPNO60542 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSPNO60542 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSPNO60542 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSPNO60542 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSPNO60542 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSPNO60542 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSPNO60542 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSPNO60542 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSPNO60542 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSPNO60542 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSPNO60542 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSPNO60542 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSPNO60542 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSPNO60542 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSPNO60542 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSPNO60542 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSPNO60542 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSPNO60542 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSPNO60542 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSPNO60542 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSPNO60542 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSPNO60542 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSPNO60542 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSPNO60542 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSPNO60542 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSPNO60542 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSPNO60542 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSPNO60542 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PSPNO60542 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSPNO60542 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSPNO60542 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSPNO60542 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSPNO60542 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSPNO60542 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSPNO60542 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSPNO60542 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSPNO60542 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSPNO60542 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSPNO60542 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSPNO60542 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSPNO60542 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSPNO60542 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSPNO60542 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSPNO60542 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSPNO60542 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSPNO60542 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSPNO60542 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSPNO60542 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSPNO60542 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSPNO60542 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSPNO60542 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSPNO60542 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSPNO60542 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSPNO60542 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSPNO60542 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSPNO60542 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSPNO60542 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSPNO60542 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSPNO60542 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PSPNO60542 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSPNO60542 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSPNO60542 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSPNO60542 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSPNO60542 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSPNO60542 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSPNO60542 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSPNO60542 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSPNO60542 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSPNO60542 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSPNO60542 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PSPNO60542 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSPNO60542 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PSPNO60542 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSPNO60542 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PSPNO60542 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSPNO60542 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSPNO60542 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSPNO60542 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSPNO60542 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSPNO60542 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSPNO60542 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSPNO60542 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PSPNO60542 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSPNO60542 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSPNO60542 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSPNO60542 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSPNO60542 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSPNO60542 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSPNO60542 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSPNO60542 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSPNO60542 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSPNO60542 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSPNO60542 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSPNO60542 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSPNO60542 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSPNO60542 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSPNO60542 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSPNO60542 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSPNO60542 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms