Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEMFO60524 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEMFO60524 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEMFO60524 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEMFO60524 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEMFO60524 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEMFO60524 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEMFO60524 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEMFO60524 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEMFO60524 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEMFO60524 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEMFO60524 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEMFO60524 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEMFO60524 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEMFO60524 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEMFO60524 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEMFO60524 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEMFO60524 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEMFO60524 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEMFO60524 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEMFO60524 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEMFO60524 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEMFO60524 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEMFO60524 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEMFO60524 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEMFO60524 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEMFO60524 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEMFO60524 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEMFO60524 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEMFO60524 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NEMFO60524 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEMFO60524 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEMFO60524 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEMFO60524 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEMFO60524 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEMFO60524 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEMFO60524 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEMFO60524 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEMFO60524 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NEMFO60524 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEMFO60524 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NEMFO60524 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEMFO60524 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEMFO60524 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEMFO60524 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEMFO60524 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEMFO60524 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEMFO60524 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEMFO60524 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEMFO60524 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEMFO60524 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEMFO60524 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NEMFO60524 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEMFO60524 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEMFO60524 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEMFO60524 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEMFO60524 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEMFO60524 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEMFO60524 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEMFO60524 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEMFO60524 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEMFO60524 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEMFO60524 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEMFO60524 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEMFO60524 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEMFO60524 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NEMFO60524 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NEMFO60524 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NEMFO60524 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEMFO60524 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEMFO60524 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEMFO60524 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEMFO60524 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEMFO60524 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEMFO60524 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEMFO60524 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEMFO60524 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEMFO60524 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEMFO60524 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEMFO60524 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEMFO60524 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEMFO60524 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEMFO60524 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEMFO60524 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEMFO60524 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEMFO60524 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEMFO60524 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEMFO60524 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEMFO60524 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NEMFO60524 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEMFO60524 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEMFO60524 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEMFO60524 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEMFO60524 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEMFO60524 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEMFO60524 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEMFO60524 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEMFO60524 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEMFO60524 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEMFO60524 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms