Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DHX16O60231 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DHX16O60231 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DHX16O60231 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DHX16O60231 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DHX16O60231 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DHX16O60231 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DHX16O60231 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DHX16O60231 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DHX16O60231 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DHX16O60231 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DHX16O60231 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DHX16O60231 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DHX16O60231 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DHX16O60231 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DHX16O60231 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DHX16O60231 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DHX16O60231 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DHX16O60231 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
DHX16O60231 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DHX16O60231 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DHX16O60231 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DHX16O60231 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DHX16O60231 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DHX16O60231 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
DHX16O60231 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DHX16O60231 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DHX16O60231 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DHX16O60231 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DHX16O60231 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DHX16O60231 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DHX16O60231 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DHX16O60231 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DHX16O60231 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DHX16O60231 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DHX16O60231 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DHX16O60231 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DHX16O60231 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DHX16O60231 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DHX16O60231 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DHX16O60231 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DHX16O60231 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DHX16O60231 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DHX16O60231 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DHX16O60231 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DHX16O60231 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DHX16O60231 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DHX16O60231 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DHX16O60231 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DHX16O60231 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DHX16O60231 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DHX16O60231 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DHX16O60231 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DHX16O60231 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DHX16O60231 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DHX16O60231 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DHX16O60231 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DHX16O60231 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DHX16O60231 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DHX16O60231 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DHX16O60231 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DHX16O60231 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DHX16O60231 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DHX16O60231 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DHX16O60231 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DHX16O60231 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DHX16O60231 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DHX16O60231 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DHX16O60231 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DHX16O60231 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DHX16O60231 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DHX16O60231 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
DHX16O60231 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DHX16O60231 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DHX16O60231 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DHX16O60231 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DHX16O60231 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DHX16O60231 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DHX16O60231 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DHX16O60231 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DHX16O60231 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DHX16O60231 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DHX16O60231 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DHX16O60231 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DHX16O60231 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DHX16O60231 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DHX16O60231 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DHX16O60231 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DHX16O60231 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DHX16O60231 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DHX16O60231 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DHX16O60231 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DHX16O60231 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DHX16O60231 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DHX16O60231 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DHX16O60231 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DHX16O60231 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DHX16O60231 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DHX16O60231 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DHX16O60231 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms