Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EXTL3O43909 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXTL3O43909 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms