Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP9BO43861 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms