Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms