Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ACTN4O43707 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms