Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF13O43567 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF13O43567 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF13O43567 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF13O43567 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF13O43567 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF13O43567 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF13O43567 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF13O43567 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF13O43567 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF13O43567 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF13O43567 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF13O43567 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF13O43567 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF13O43567 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF13O43567 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF13O43567 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF13O43567 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF13O43567 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF13O43567 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF13O43567 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF13O43567 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF13O43567 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF13O43567 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF13O43567 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF13O43567 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF13O43567 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF13O43567 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF13O43567 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF13O43567 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF13O43567 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF13O43567 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF13O43567 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF13O43567 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF13O43567 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF13O43567 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF13O43567 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF13O43567 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF13O43567 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF13O43567 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF13O43567 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF13O43567 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF13O43567 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF13O43567 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF13O43567 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF13O43567 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF13O43567 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF13O43567 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF13O43567 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RNF13O43567 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RNF13O43567 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RNF13O43567 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF13O43567 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF13O43567 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF13O43567 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF13O43567 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF13O43567 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF13O43567 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF13O43567 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF13O43567 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF13O43567 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF13O43567 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF13O43567 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF13O43567 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF13O43567 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF13O43567 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF13O43567 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF13O43567 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF13O43567 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF13O43567 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF13O43567 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF13O43567 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF13O43567 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF13O43567 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF13O43567 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF13O43567 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF13O43567 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF13O43567 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF13O43567 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF13O43567 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF13O43567 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF13O43567 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF13O43567 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF13O43567 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF13O43567 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF13O43567 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF13O43567 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF13O43567 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF13O43567 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF13O43567 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF13O43567 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF13O43567 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF13O43567 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF13O43567 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF13O43567 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF13O43567 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF13O43567 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF13O43567 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF13O43567 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF13O43567 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms