Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms