Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MSI1O43347 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSI1O43347 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSI1O43347 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSI1O43347 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSI1O43347 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MSI1O43347 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSI1O43347 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSI1O43347 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSI1O43347 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MSI1O43347 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSI1O43347 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSI1O43347 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSI1O43347 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSI1O43347 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSI1O43347 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSI1O43347 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSI1O43347 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSI1O43347 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSI1O43347 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSI1O43347 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSI1O43347 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSI1O43347 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MSI1O43347 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSI1O43347 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MSI1O43347 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSI1O43347 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSI1O43347 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MSI1O43347 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSI1O43347 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSI1O43347 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSI1O43347 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSI1O43347 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSI1O43347 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSI1O43347 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSI1O43347 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSI1O43347 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSI1O43347 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSI1O43347 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSI1O43347 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSI1O43347 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSI1O43347 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSI1O43347 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSI1O43347 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSI1O43347 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSI1O43347 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSI1O43347 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSI1O43347 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSI1O43347 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSI1O43347 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSI1O43347 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSI1O43347 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSI1O43347 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSI1O43347 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSI1O43347 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSI1O43347 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSI1O43347 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSI1O43347 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSI1O43347 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSI1O43347 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSI1O43347 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSI1O43347 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSI1O43347 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSI1O43347 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSI1O43347 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSI1O43347 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSI1O43347 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MSI1O43347 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSI1O43347 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSI1O43347 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSI1O43347 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MSI1O43347 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MSI1O43347 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSI1O43347 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSI1O43347 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSI1O43347 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSI1O43347 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MSI1O43347 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSI1O43347 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSI1O43347 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MSI1O43347 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSI1O43347 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MSI1O43347 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MSI1O43347 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MSI1O43347 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MSI1O43347 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MSI1O43347 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSI1O43347 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSI1O43347 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSI1O43347 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MSI1O43347 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSI1O43347 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSI1O43347 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSI1O43347 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSI1O43347 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSI1O43347 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSI1O43347 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSI1O43347 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSI1O43347 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSI1O43347 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms