Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRTM2O43300 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRTM2O43300 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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