Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN3O15551 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms