Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PFDN6O15212 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PFDN6O15212 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms