Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEMA3EO15041 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms