Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLGNO14967 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLGNO14967 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLGNO14967 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLGNO14967 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLGNO14967 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLGNO14967 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLGNO14967 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLGNO14967 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLGNO14967 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLGNO14967 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLGNO14967 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLGNO14967 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLGNO14967 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLGNO14967 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLGNO14967 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLGNO14967 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLGNO14967 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLGNO14967 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLGNO14967 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLGNO14967 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLGNO14967 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLGNO14967 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLGNO14967 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLGNO14967 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLGNO14967 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLGNO14967 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLGNO14967 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLGNO14967 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLGNO14967 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLGNO14967 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLGNO14967 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLGNO14967 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLGNO14967 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLGNO14967 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLGNO14967 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLGNO14967 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLGNO14967 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLGNO14967 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLGNO14967 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLGNO14967 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLGNO14967 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLGNO14967 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLGNO14967 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLGNO14967 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLGNO14967 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLGNO14967 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLGNO14967 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLGNO14967 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLGNO14967 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLGNO14967 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLGNO14967 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLGNO14967 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLGNO14967 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLGNO14967 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLGNO14967 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLGNO14967 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLGNO14967 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLGNO14967 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLGNO14967 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLGNO14967 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLGNO14967 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLGNO14967 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLGNO14967 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLGNO14967 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLGNO14967 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLGNO14967 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLGNO14967 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLGNO14967 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLGNO14967 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLGNO14967 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLGNO14967 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLGNO14967 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLGNO14967 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLGNO14967 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLGNO14967 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLGNO14967 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLGNO14967 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLGNO14967 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLGNO14967 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLGNO14967 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLGNO14967 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLGNO14967 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLGNO14967 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLGNO14967 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLGNO14967 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLGNO14967 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLGNO14967 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLGNO14967 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLGNO14967 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLGNO14967 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLGNO14967 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLGNO14967 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLGNO14967 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLGNO14967 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLGNO14967 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLGNO14967 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLGNO14967 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLGNO14967 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLGNO14967 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms