Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDC80O14777 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDC80O14777 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDC80O14777 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDC80O14777 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDC80O14777 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDC80O14777 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDC80O14777 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDC80O14777 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDC80O14777 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDC80O14777 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDC80O14777 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDC80O14777 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDC80O14777 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDC80O14777 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDC80O14777 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NDC80O14777 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDC80O14777 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDC80O14777 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDC80O14777 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDC80O14777 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDC80O14777 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDC80O14777 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDC80O14777 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDC80O14777 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDC80O14777 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDC80O14777 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDC80O14777 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDC80O14777 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDC80O14777 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDC80O14777 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDC80O14777 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDC80O14777 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDC80O14777 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDC80O14777 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDC80O14777 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDC80O14777 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDC80O14777 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDC80O14777 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDC80O14777 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDC80O14777 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDC80O14777 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDC80O14777 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDC80O14777 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDC80O14777 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NDC80O14777 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDC80O14777 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDC80O14777 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDC80O14777 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDC80O14777 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDC80O14777 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDC80O14777 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDC80O14777 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDC80O14777 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDC80O14777 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDC80O14777 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDC80O14777 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDC80O14777 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDC80O14777 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDC80O14777 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDC80O14777 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDC80O14777 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDC80O14777 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDC80O14777 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDC80O14777 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDC80O14777 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDC80O14777 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NDC80O14777 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDC80O14777 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDC80O14777 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDC80O14777 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDC80O14777 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDC80O14777 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDC80O14777 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDC80O14777 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDC80O14777 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDC80O14777 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDC80O14777 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDC80O14777 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDC80O14777 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDC80O14777 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDC80O14777 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDC80O14777 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDC80O14777 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDC80O14777 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDC80O14777 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDC80O14777 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDC80O14777 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDC80O14777 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDC80O14777 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDC80O14777 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDC80O14777 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDC80O14777 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDC80O14777 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NDC80O14777 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDC80O14777 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDC80O14777 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDC80O14777 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDC80O14777 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NDC80O14777 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms