Protein–RNA interactions for Protein: O14561

NDUFAB1, Acyl carrier protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAB1O14561 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFAB1O14561 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms