Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM38O00635 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM38O00635 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM38O00635 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM38O00635 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM38O00635 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM38O00635 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM38O00635 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM38O00635 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM38O00635 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM38O00635 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM38O00635 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM38O00635 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM38O00635 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM38O00635 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms