Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP1O00294 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP1O00294 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP1O00294 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP1O00294 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP1O00294 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP1O00294 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP1O00294 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP1O00294 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP1O00294 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP1O00294 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP1O00294 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP1O00294 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP1O00294 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP1O00294 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP1O00294 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP1O00294 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP1O00294 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP1O00294 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP1O00294 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP1O00294 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP1O00294 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TULP1O00294 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TULP1O00294 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TULP1O00294 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TULP1O00294 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TULP1O00294 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TULP1O00294 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TULP1O00294 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TULP1O00294 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TULP1O00294 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TULP1O00294 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TULP1O00294 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TULP1O00294 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TULP1O00294 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TULP1O00294 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TULP1O00294 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TULP1O00294 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TULP1O00294 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TULP1O00294 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TULP1O00294 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TULP1O00294 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TULP1O00294 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TULP1O00294 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TULP1O00294 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TULP1O00294 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TULP1O00294 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TULP1O00294 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TULP1O00294 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TULP1O00294 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TULP1O00294 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TULP1O00294 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TULP1O00294 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TULP1O00294 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TULP1O00294 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TULP1O00294 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TULP1O00294 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TULP1O00294 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TULP1O00294 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TULP1O00294 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TULP1O00294 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TULP1O00294 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TULP1O00294 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TULP1O00294 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TULP1O00294 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TULP1O00294 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TULP1O00294 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TULP1O00294 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TULP1O00294 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TULP1O00294 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TULP1O00294 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TULP1O00294 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TULP1O00294 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TULP1O00294 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TULP1O00294 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TULP1O00294 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TULP1O00294 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TULP1O00294 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TULP1O00294 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TULP1O00294 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TULP1O00294 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TULP1O00294 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TULP1O00294 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TULP1O00294 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TULP1O00294 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TULP1O00294 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TULP1O00294 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TULP1O00294 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TULP1O00294 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TULP1O00294 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TULP1O00294 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TULP1O00294 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TULP1O00294 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TULP1O00294 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TULP1O00294 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TULP1O00294 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TULP1O00294 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TULP1O00294 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TULP1O00294 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TULP1O00294 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms