Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNAP23O00161 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SNAP23O00161 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAP23O00161 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms