Protein–RNA interactions for Protein: J3KTA2

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KTA2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3KTA2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3KTA2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3KTA2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3KTA2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3KTA2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3KTA2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3KTA2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3KTA2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3KTA2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3KTA2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3KTA2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3KTA2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3KTA2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3KTA2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3KTA2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3KTA2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3KTA2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3KTA2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3KTA2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
J3KTA2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
J3KTA2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3KTA2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3KTA2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3KTA2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3KTA2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3KTA2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3KTA2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3KTA2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3KTA2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3KTA2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3KTA2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3KTA2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3KTA2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KTA2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KTA2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KTA2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KTA2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KTA2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KTA2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KTA2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KTA2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KTA2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KTA2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3KTA2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KTA2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KTA2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KTA2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KTA2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KTA2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KTA2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KTA2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KTA2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KTA2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KTA2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3KTA2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KTA2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KTA2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KTA2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KTA2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KTA2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KTA2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KTA2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KTA2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KTA2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KTA2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KTA2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KTA2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KTA2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KTA2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3KTA2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KTA2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KTA2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KTA2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KTA2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KTA2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KTA2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KTA2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KTA2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KTA2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KTA2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KTA2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KTA2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KTA2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KTA2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KTA2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KTA2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KTA2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KTA2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KTA2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KTA2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KTA2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KTA2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KTA2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KTA2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KTA2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KTA2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KTA2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KTA2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KTA2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms